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    我会副理事长赵涵团队与中国农大合作构建了玉米Mutator转座子突变体资源库
    发布时间:2019/11/12 17:07:33  浏览次数:

    我会副理事长赵涵团队与中国农大合作构建了

    玉米Mutator转座子突变体资源库

       

    我会副理事长、江苏省农业科学院赵涵研究员团队与中国农业大学宋任涛教授团队和上海大学合作在国际著名学术期刊Plant Physiology发表了“A sequence-indexed Mutator insertional library for maize functional genomics study”的研究论文。

    该研究报道了我国独立构建了玉米Mutator转座子突变体资源数据库(ChinaMu)。该数据库是目前世界上最大的玉米插入资源库,将成为全球玉米功能基因研究的重要资源。该研究利用玉米Mutator转座子活性系创制了大型转座突变体库,并结合了分子生物学、基因组学和生物信息学手段,对2,581个转座家系进行了转座子插入位点的分离和分析,鉴定到约97,000个可遗传的Mu插入位点。插入位点数是之前国际上最主要的Mutator插入资源库(UniformMu)的两倍。对其中66,565个高质量插入位点的分析表明,ChinaMu资源库已经覆盖了玉米20,24445.7%)的基因,其中13,42566.3%)个基因有两个及以上的插入。ChinaMu和已有的UniformMu联合使用,可以覆盖约52.2%的玉米基因。本研究中所得的插入位点数据,可通过网站进行查询:http://chinamu.jaas.ac.cn/Default.aspx
       
    该论文由江苏省农科院周玲、中国农业大学博士研究生梁磊、李念櫆以及上海大学唐远平为论文的共同第一作者。江苏省农业科学院赵涵研究员和中国农业大学宋任涛教授为论文的共同通讯作者。

                                                               学会秘书处

     

    1.   ChinaMu的杂交方案及试验过程

     




    图2.  ChinaMu和UniformMu插入位点覆盖的基因结构和基因数目

     图3. ChinaMu的在线检索平台



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